Флаг Пограничных войск России представляет собой прямоугольное полотно красно-зеленого цвета. Рисунок флага – четырехконечный зеленый крест с расширяющимися концами с белой окантовкой. В центре креста расположено изображение эмблемы Федеральной Пограничной службы России с серебряными мечами (эмблема Пограничных войск ФПС России), также имеется надпись "ГРАНИЦА НА ЗАМКЕ". Яркое изображение с двух сторон флага.
Полотно флага оснащено карманом под флагшток, есть закрепляющие завязки снизу. Максимальный диаметр флагштока - 3 см. Флаг выполнен из плотного полиэстера. Размер - 90х135 см, плотность материала - 68 ден. Флагшток не входит в комплект.